Em 30 anos as populações de piracanjuba nos rios se reduziram a metade. A construção de barragens, a destruição do habitat e a pesca predatória foram as principais causas para o seu declínio. A área de ocorrência original do peixe era de 1 milhão de km², porém atualmente a piracanjuba só habita um pequeno trecho do alto do rio Paraná, em uma área de 25 mil km², cerca de 3% da sua extensão original.
A piracanjuba é protegida por Instituições federais como a APA das Ilhas e Várzeas do rio Paraná e Parque Nacional de Ilha Grande. Também existem projetos de repovoamento da espécie em rios do estado de São Paulo.
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